甲状腺功能三项主要在临床上是指的FT3、FT4以及TSH。FT3、FT4以及TSH的检测，可以初步的判断是否合并甲状腺的相关疾病。
首先FT3和FT4明显的升高而TSH降低，则有可能合并甲状腺功能亢进症，则需要完善甲状腺相关的抗体以及结合临床症状，判断是否合并甲状腺功能亢进症，是否启动药物治疗。
其次如果FT3和FT4明显的降低以及TSH明显升高，有可能合并甲状腺功能减退症，则需要进一步的完善甲状腺的彩超以及甲状腺相关抗体，明确是否合并其他自身免疫性的甲状腺疾病。
如果排除合并其他自身免疫性疾病，只是单纯甲状腺功能减退症，则需要在专业内分泌科医生指导下启动药物治疗。