肾结核绝大多数情况下肾脏是不会疼痛的，除非肾结核并发其他的疾病或者出现肾结核自己合并了，出现肾脏的并发症，例如积水、感染或者出血的情况。肾结核往往继发于机体其他部位的结核，最常见的部位就是肺结核。肺结核处于活动期的时候，结核杆菌就会随着血液进入到肾脏，造成肾结核的发生。
这个时候往往是没有任何感觉的，只有病人在查体的时候或者其他疾病做检查的时候才能发现，或者尿液中出现尿频或者终末期血尿才能发现肾结核。这个时候做相应的血液、尿液，以及影像学检查可以进一步发现肾结核的情况。如果发生了肾结核，就需要积极地应用药物来进行治疗，以避免发生肾结核等严重的后果，最严重的后果就是发生肾自截。也就是说这个肾脏出现功能完全丧失，完全丧失掉，相当于肾脏切除。