滴虫性阴道炎的主要发病原因是经性交的直接传播，这是主要的传播方式。滴虫在阴道里面没有存在，但是它可以寄生在阴道，还可以侵入到尿道、尿道旁腺，甚至膀胱、肾盂，引发多种症状。经性交的直接传播，是它主要的传播方式。
滴虫可以寄生在男性的包皮皱褶、尿道或者前列腺里面，男性由于感染滴虫以后常常没有症状，易成为传染源，所以性接触传播是主要的传播途径。也有一些其他的间接传播方式，比如可以经公共浴池、浴盆、浴巾、浴缸、游泳池、坐式便器、衣物、污染器械，以及敷料等间接传播。