肝硬化的患者肝功能不正常，肝脏的功能表现为肝脏的合成功能和肝脏解毒功能。肝脏的合成功能体现在白蛋白合成和凝血因子合成，另外解毒功能，各种体内的毒素，比如雌激素、雄激素以及血氨等需要在肝脏灭活。出现肝硬化之后，肝脏的这些解毒以及合成功能会出现下降，所以会出现相应的低白蛋白血症，出现肝性脑病等并发症。
肝硬化的患者，肝生化的指标可以出现异常，也可以出现正常，但肝生化的指标和肝功能是两个概念。肝生化的指标如果持续稳定正常，可以保证肝脏不进展，但通常需要针对肝硬化的病因治疗，才能够维持肝生化学的指标正常。有些肝硬化的患者会出现肝生化的指标持续或者间断异常，如果针对病因治疗效果不好，肝生化的指标持续异常，病情还会进展，肝癌的几率发生也会升高。