6cm的卵巢囊肿能否自己消失，要看卵巢囊肿的性质而定。卵巢囊肿是生育年龄女性较为常见的妇科疾病，很多女性都有卵巢囊肿。根据卵巢囊肿的性质不同，临床上较为常见的卵巢生理性囊肿、卵巢子宫内膜异位囊肿，也就是所说的卵巢巧克力囊肿，还有卵巢的炎性囊肿。另外卵巢上皮性肿瘤、浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等，在超声检查时也会表现为卵巢的囊性肿物。卵巢囊肿是否能自己消失，要看卵巢囊肿是哪一类型，具体如下：
1、卵巢的生理性囊肿一般出现在月经的后半期，经过2-3个月经周期观察，在月经刚刚结束时进行超声复查，往往囊肿会缩小，甚至消失。
2、卵巢子宫内膜异位囊肿大多数是不能自行消失的，卵巢的炎性囊肿经过抗炎治疗或者中药的活血化瘀治疗，也有可能会自己消失。
3、病理性的卵巢囊肿、卵巢上皮性肿瘤是不能自己消失的。