大部分的颌骨囊肿都会通过手术刮治的办法来治疗。如果对于特别巨大的颌骨囊肿，也可以采用囊壁开创，囊肿减压、冲洗的办法来治疗。颌骨囊肿，把它的囊壁打开以后囊液流出来，囊肿内的压力减轻，颌骨就会逐渐的修复被囊肿破坏的骨质，使得病变区逐渐变小。等到颌骨囊肿缩小到一定程度的时候，再采用手术的办法彻底的把囊肿里面的囊壁刮干净，从而达到保存颌骨完整性的治疗办法。