过敏性结膜炎的患者，治疗时需要脱离过敏原，然后合理使用药物，常用药物有以下几种：
1、抗过敏药物：包括肥大细胞膜稳定剂、抗组胺眼药水，例如埃美丁滴眼液、帕坦洛滴眼液等。
2、抗炎及人工泪液药物：抗炎治疗是治疗过敏性结膜炎的关键，常用药物包括激素类眼药水、免疫抑制剂眼药水、非甾体类的眼药水，包括氟米龙滴眼液、典必殊滴眼液、环孢素滴眼液、普拉洛芬滴眼液等，需要指出的是，激素类的眼药水不能长期使用，谨防导致青光眼，同时还可以辅助使用人工泪液缓解眼部干涩的症状，
3、口服药物：对于重度的过敏性结膜炎，往往伴有全身的过敏症状，这时需要在局部使用眼药水的基础上，配合全身应用抗过敏药物，如扑尔敏等。