灰指甲如果发生了自体传染，说明没有得到有效的控制。在治疗之前患者需要先把病甲尽量去除，可以应用小刀或者药物封包的方式使指甲脱落，再用外涂的药物进行治疗，常用的有碘酊、冰醋酸溶液、环吡酮、阿莫罗芬，这些药物应用疗程比较长，需要三个月左右，一直需要应用到患者新的指甲长出来为止。患者也需要配合口服抗真菌的药物治疗，像伊曲康唑以及特比萘芬都是常用的。灰指甲患者在治疗期间一定要注意自己的私人物品专人专用，像毛巾、手套、私密衣物、指甲剪，也都要专人专用，不能混用。