牙龈炎一般是由厌氧菌和需氧菌引起的混合感染，因此可以服用具有广谱抗菌功能的头孢类抗生素、四环素，同时配合服用抗厌氧菌感染的甲硝唑或奥硝唑。在牙龈局部可以涂抹碘甘油，或者盐酸米诺环素软膏来消除牙周炎症。
也可以采用具有消炎功能的漱口水，比如氯己定含漱液和替硝唑含漱液漱口。牙龈炎致病因子是牙龈周围的牙菌斑和牙石，因此祛除掉这些治病因素才是根治牙龈炎的方法。
临床上治疗牙龈炎的方法是超声洁治，也就是洗牙，采用超声波的高频震荡和冲洗清除掉牙龈周围的牙石和牙菌斑，创造良好的口腔卫生环境，牙龈炎症就会逐渐康复。