肛门狭窄手术，是不会给患者造成较大痛苦的，首先在做肛门狭窄手术时，通常都会使用麻醉剂，所以手术的过程中患者，是不会感到丝毫疼痛的感觉，而且肛门狭窄手术属于小型手术，本身所需要的时间较短，一般半个小时就可以完成。
不会给患者形成较大压力，手术的风险也较小。其次在手术之后麻醉剂散尽，会出现伤口疼痛的症状，主要是由于肛门狭窄手术，需要将引起肛门狭窄的瘢痕。
甚至是肛门括约肌进行切除，会在肛门组织上留下一定的伤口，因而会留下疼痛的感觉。需要注意的是，由于肛门周围组织恢复较慢，大约需要3-4周的时间，加上排便对伤口的刺激，所以疼痛的时间可能较长，大约会持续10-15天。