子宫腺肌症的治疗，应该根据患者的症状、年龄、生育要求来决定，目前没有根治性的有效药物。对于症状较轻，有生育要求或者接近绝经年龄的患者，可以使用达那唑、孕三烯酮、亮丙瑞林、戈舍瑞林等药物，也可以采用左炔诺酮孕酮宫内缓释系统治疗，均可以缓解症状。一般用药以后，可以出现6-9个月的停经，在用药的时候需要注意药物的副作用，在停药以后症状有可能再次出现。因为用药期间月经停止，宫内膜异位的症状就会得到控制，子宫腺肌症的病情就会得到控制，但是当药物停止以后月经再次来潮，子宫腺肌症的病情又可能再次出现反复。
在使用亮丙瑞林、戈舍瑞林等药物性卵巢切除治疗的过程当中，应该注意患者骨丢失的风险，可以补充适当钙剂。年轻或者希望生育的宫腺肌瘤患者可以做手术，做病灶切除手术，也就是腺肌瘤的挖除手术。手术以后有复发的风险，所以手术以后建议配合刚刚前面提到的药物治疗，使月经停闭6-9个月，以达到控制复发的效果。对于症状严重、没有生育要求，或者药物治疗无效者，应该做子宫全切手术。是否保留卵巢，取决于卵巢有没有病变和患者的年龄。