神经官能症属于心因性疾病，在治疗上应该以精神治疗为主、药物治疗为辅以及配合其他的治疗方法，如物理治疗等。可以转移患者的注意力并且给患者进行心理疏导，对于神经官能症有着比较好的治疗效果，并且在必要的时候考虑服用药物治疗，如治疗抑郁症的药物，也可以在适当的情况下使用抗焦虑的药物等。
最适合的方法是进行中医中药的治疗，中医中药的治疗可以调理患者的气血，并且对血虚的患者进行养血补气的治疗方法，以及对于脾虚的患者进行健脾益气的治疗，失眠比较重的可以进行养心安神的治疗，如果存在心火比较旺盛也可以调整患者心火盛的情况。还要定期复查患者，神经官能症也有可能伴有其他的疾病而导致患者心因性疾病的产生。