泌尿系结石的治疗方法很多，泌尿系结石通常分为肾结石、输尿管结石、膀胱结石等，治疗方法要根据结石的部位和大小，结石大于0.6cm以上的，药物排石或者自己排石的可能性很小。
比较大的结石，0.6cm以上的结石需要通过体外冲击波碎石来进行治疗，2cm以上的肾结石需要经皮肾镜或者输尿管软镜进行治疗，对于输尿管结石现在常用的方法就是输尿管镜治疗，大部分结石都可以得到治疗。
另外，对于合并有输尿管狭窄的或肾积水比较明显的结石，也可以采用腹腔镜的方法来进行治疗。对于石头不是很大，但是保守治疗方法下不来的病人，比如体外冲击波碎石、药物治疗失败的结石病人，也可以采用微创手术的方法，输尿管镜、输尿管软镜或者经皮肾镜的方法来进行治疗。