腰椎结核主要是一种继发性结核，原发病灶通常在肺结核和消化道结核，因此是由以上两个途径传播而来，在我国以原发于肺结核占大多数。腰椎结核可以出现在原发性结核活动期，但大多数发生于原发病灶已经静止，多年以后甚至痊愈。
在原发病灶活动期，结核杆菌经血液循环到达腰椎部位，但不会立刻发病，在腰椎可以潜伏多年，待机体的免疫力下降，如外伤、营养不良、过度劳累等诱发因素，都可以促使潜伏的结核杆菌活跃起来，而出现临床症状。如果机体的抵抗力增强，潜伏的结核杆菌可以被抑制，甚至被消灭。腰椎是负重比较大、活动比较多的脊柱，容易发生创伤，因此在整个脊柱结核的病灶中，腰椎最容易发生。