小儿手足口病中医的治疗方法主要是应用清热解毒的中草药，一般在患儿急性期的时候，如果出现有低热、咽红、疼痛、纳差、恶心等症状的时候，可以选择应用银翘散方剂。
而对于孩子有持续的高热，口腔、手掌、足底、臀部、四肢存在明显疱疹的情况下，可以选择用清瘟败毒饮方剂，同时对于合并有高热不退、频繁咳嗽、气急等并发症的孩子，可以应用己椒苈黄丸和参附汤方剂。对于有咽干、咽痛的孩子，在疾病康复期的时候，可以在沙参麦冬汤方剂里面加上地黄、芦根，可以养阴生津、清热润咽。