疟疾的症状常表现为畏寒、寒战、全身打哆嗦，大约持续20-60分钟的时间，可以出现高热，常常可以达到40℃。高热期间可以伴有全身肌肉酸痛、关节疼痛、头疼，大约持续30-60分钟体温可以突然下降，伴有全身的大汗淋漓，随后全身症状逐渐缓解，进入到间歇期，间歇期病人可以感觉到乏力、口渴。
如果感染的间日疟或者卵形疟，可以出现隔日发作，也就是间歇期为48个小时。如果感染的是三日疟，间歇期为72个小时，隔两天发作一次。如果感染的是恶性疟，发作基本上没有规律。对于脑型疟疾，患者除了上述症状之外，可以表现为头疼、神志的改变，如果感染的是恶性疟疾，也可以出现肾损害，病人可以表现为少尿，尿的颜色可以表现为酱油样，也就是血红蛋白尿，主要是由于大量的红细胞破坏所导致。