桉柠蒎肠溶胶囊主要使用在呼吸道黏膜炎症性疾病，对呼吸道黏膜表面存在的炎症渗出液，具有促进黏膜排泄的作用，比如有鼻窦炎存在，鼻窦的黏膜出现了充血、水肿、大量的黏液渗出导致细菌感染后，会引发大量的鼻涕阻塞鼻腔，通过使用桉柠蒎肠溶胶囊加速鼻腔及鼻窦内的脓性分泌物排泄后，有利于鼻窦炎的恢复。
使用桉柠蒎肠溶胶囊，必须使用温凉的开水送服，避免使用过烫的开水导致桉柠蒎肠溶胶囊的主要成分发生变性的现象，影响到药物的功效。
桉柠蒎肠溶胶囊主要使用在支气管炎或者鼻窦炎疾病的分泌物排泄过程上，在治疗的时候可以联合使用敏感抗生素，加强对疾病的抗炎效果。