抑郁症的主要药物治疗是新型的抗抑郁药，包括选择性的5-羟色胺再摄取抑制剂，即SSRI类药物，还有SNRI以及新型的抗抑郁药，还有单胺氧化酶抑制剂、新型的单胺氧化酶抑制剂，如吗氯贝胺等等。
SSRl类药应用比较多，主要是五朵金花，有氟西汀、帕罗西汀、舍曲林、氟伏沙明、西酞普兰这五种药，疗效都比较肯定，且副作用比较小。SNRl类的药物文拉法辛的效果也比较好，起效比较快。其他的例如米氮平效果也比较好，还有一定的助眠、提高食欲的作用，还有吗氯贝胺新型的单氧化酶抑制剂，对于患者也有比较好的效果。