腱鞘囊肿最好发于手背和足背这两个位置，在囊肿比较大或者引起不适的情况下，可以进行囊肿切除术。手术比较简单，但也有注意的点：
1、手术的切口尽量按照皮纹的方向进行切开，这样可以减少对关节活动的干扰，手术疤痕也比较小。
2、麻醉的方式，一般不要选择局部麻醉，局部麻醉会引起软组织肿胀，囊肿的囊壁显露不清，也有渗血，会导致囊肿的破裂，不容易切干净，应该选择在肢体近端进行神经阻滞麻醉，同时在止血带的控制下进行手术，这样手术视野非常清晰。
3、尽量完整切除囊肿，有时囊肿是分叶状的，应该尽量分离清楚，完整切除。
4、要找到囊肿与关节腔相通的部位，在相通的部位切断，囊肿才不容易复发。
5、囊肿切除后要对囊肿根部的关节囊进行加强的缝合，关闭关节囊的薄弱区，杜绝以后囊肿出现复发的可能性。
6、因为囊肿切除之后，局部可能产生一个空腔，容易积血并继发感染，因此切除囊肿之后最好在局部放一个引流条，待术后24小时拔除，减少局部形成血肿的可能性。