宫颈纳氏囊肿不会自愈，宫颈纳氏囊肿已经形成了就不会消失，但是宫颈纳氏囊肿并不一定是疾病，子宫颈的纳氏囊肿绝大多数情况下是子宫颈的生理性变化。子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口，或深入腺管，将腺管口堵塞，导致腺体分泌物引流受阻、潴留，形成囊肿。
子宫颈局部损伤或者子宫颈慢性炎症使腺管口狭窄，也可以导致子宫颈腺囊肿的形成。浅部的子宫颈腺囊肿，可以通过妇科检查，看见子宫颈表面突出单个，或者多个青白色的小囊疱，容易诊断。子宫颈腺囊肿一旦形成，就不会自己消失，但是子宫颈腺囊肿通常不需要处理，只需要每年坚持做宫颈的防癌筛查。