目前针对乙型肝炎(即乙肝)病毒的抗病毒药物，对cccDNA没有直接的影响，这是大多数情况下无法临床治愈慢性乙型肝炎病毒感染的主要原因。在乙型肝炎病毒复制过程中，病毒DNA进入宿主细胞核，在DNA聚合酶的作用下，形成共价闭合环状的DNA分子，也称cccDNA。cccDNA是乙肝病毒全基因组RNA复制的原始模板，虽然其含量较少，每个肝细胞内只有约5-50copies，但对乙肝病毒的复制以及感染状态的建立具有十分重要的意义。只有清除了细胞核内的cccDNA，才能彻底清除乙肝患者的病毒携带状态，这是抗病毒治疗的目标。
目前还没有直接以cccDNA为靶点的上市药物，免疫系统降解cccDNA的作用也很有限。因此，只能靠cccDNA耗竭或者是感染的肝细胞死亡，才可能彻底清除。而cccDNA十分稳定、持久，肝细胞也是长寿细胞，所以，cccDNA的完全清除、慢乙肝完全治愈，还要指望新药出现，甚至是多种药物联合治疗。