高位复杂肛瘘手术的恢复期大概在两个月左右，具体时间需要结合术后的护理和个人恢复情况才能确定。首先是在肛瘘手术后的前几天，应当卧床休息，饮食上应当以清淡营养的流质、半流质食物为主，可以喝一些蔬菜汤、小米粥等，补充体能并注意创口的愈合情况，及时换药、观察有无出现感染和创口开裂的现象，之后可以进行适当的日常护理和饮食调节，坚持每日清洗局部，保持局部干净卫生，并可食用高锰酸钾溶液、消炎的中药药剂等对肛门处进行坐浴，促进创口愈合，减少炎症发生的可能性，持续一至二个月的时间后，可以逐步恢复到正常的生活饮食，但仍需注意减少食用辛辣、油腻、煎烤类食物，以免引起肠胃不适。