灰指甲经过规范的抗真菌药物治疗是可以恢复的，灰指甲也称之为甲真菌病，是指真菌感染甲板或甲下引起的皮肤病。甲真菌病由于甲板的角化，药物不易透入，一直是治疗的难点。近年来由于唑类药物和丙烯胺类药物的问世，甲真菌病的治疗有了很大的进展。
甲真菌病的治疗可以口服、外用药物或手术拔甲，由于手指甲和脚趾甲的生长速度不同，完全替换一个新的指甲，手指甲需要100天，而脚趾甲大概需要300天。所以治疗灰指甲必须要有耐心，可以口服药物，例如口服特比萘芬或伊曲康唑，可以治愈80%以上的甲真菌病。但是由于这一类药物必须达到真菌所寄生的甲板处，才能发挥抗菌的作用，所以用药时间比较长，因此应定期监测药物的不良反应。甲真菌病的外用药物治疗，例如特比萘酚、阿莫罗芬搽剂、环吡酮胺甲涂剂等，配合口服抗真菌药，目前均取得比较好的疗效。