新生儿蛛网膜下腔出血，大部分没有临床症状，预后比较良好。只有极个别的典型病例表现为生后第二天出现抽搐，但是发作呈间断性，极少数病例如果出现大量的蛛网膜下腔出血，可以引起反复中枢性的呼吸暂停、惊厥、昏迷，于短期内可能危及新生儿的生命。
主要的后遗症为交通性或者阻塞性的脑积水，因为新生儿蛛网膜下腔，在新生儿期还是十分常见，尤其是在早产儿，和缺氧、缺血、酸中毒、产伤等因素有关系。由于缺氧引起的比较多见，所以可以导致蛛网膜下腔的毛细血管内血液外渗，而并不是静脉破裂，所以大多数出血量都比较少，预后都比较好。