肾盂分离如何处理，需要根据实际情况进行判断。如果是功能性造成，就是功能性肾脏积水形成，常见于做泌尿系统彩超或者妇科彩超时，可能出现过度膀胱充盈，以及女性增大子宫压迫肾脏或者输尿管，从而造成肾盂分离，出现肾脏积水。
排除该情况，就是器质性病变造成，例如泌尿系统结石、炎症、感染、结核、肿瘤、占位等，由于可以造成肾盂以及肾盏分离，造成肾脏积水形成。需要泌尿外科积极进行处理，解除结石、感染以及占位性病变，使肾脏积水得到良好解除，肾盂分离就可以得到缓解，使疾病得到及时治疗。