尖锐湿疣初期的主要表现就是在外生殖器或者肛门周围单发或者是多发的小丘疹，通常来讲质地柔软、表面湿润、顶端尖锐，可有小细刺状的突起，颜色多是肉色或者淡红色。如果是长在包皮内侧、肛周等比较潮湿摩擦的部位，尖锐湿疣颜色往往偏白色或灰白色，而且表面很湿润。
如果是长在包皮外侧、阴茎根部等处，往往表面干燥，角化比较明显，质地比较硬，颜色也比较深。尖锐湿疣在早期有时候容易和其他疾病相混淆，比如局部皮脂腺异位、阴茎珍珠状丘疹，或者是女性的绒毛状小阴唇等这些都需要有经验的医生仔细地鉴别和区分。