吗啡连续用3-5天就可以产生耐药性，一周以上可以成瘾，所以对疼痛的病人用药要适当。还可以出现恶心、呕吐、呼吸抑制、嗜睡、眩晕、便秘、排尿困难、胆绞痛，偶尔可以出现瘙痒、荨麻疹、皮肤水肿等过敏现象。
这种药急性中毒的症状是昏迷、呼吸抑制，出现瞳孔极度缩小、两侧对称，并呈针尖样大，还有血压下降、尿少。可以出现体温下降、皮肤湿冷、肌肉无力，严重的可以出现缺氧性休克、昏迷、循环衰竭、瞳孔散大、死亡。
吗啡主要是强效的镇痛药，适用于其他镇痛药无效的急性疼痛，比如严重的创伤、战伤、烧伤、晚期癌症患者，心肌梗死而血压正常的时候可以使用本品来镇痛，可以减轻心脏的负担。对于心源性的哮喘也可以使肺水肿暂时缓解，麻醉前给药，让病人能够进入嗜睡状态。吗啡有令平滑肌兴奋的作用，所以不能单独用于内脏性的绞痛，如胆绞痛、肾绞痛等等，应该与具有解痉作用的阿托品联合使用。