翼状胬肉手术属于外眼手术，一般没什么大的风险，但是做手术当中要注意细节。翼状胬肉的头部附着在角膜上，刮除这种组织的时候，对角膜的损伤要尽可能降到最低。减除翼状胬肉体部的时候，要避免眼睛的直接损伤。剥离结膜的时候，要避免过多的粘连，减少手术的影响。
翼状胬肉手术为什么在很小的时候不做，而非要等到跨过角膜缘或者长到黑眼珠上才做，其实这个反而是一种很大的问题，叫做术后复发。这虽然是个常见的小病，但是复发率比较高，一般20%-30%的人术后会复发，所以早期刺激也是可能会引起复发的因素，所以到了后期引起散光或者视力下降，这时候也不考虑复发。术中会用羊膜移植或者是角膜缘干细胞移植来减少复发，但是目前还没有很明显的方法，完全避免术后的复发。