激光飞秒治疗近视后遗症比较少见，可能会出现的后遗症有以下几种：
1、干眼症：激光飞秒手术也要做角膜瓣或角膜切口，角膜基质层透镜取出，角膜的形态会发生改变，角膜有伤口，泪膜稳定性、形态会发生改变，很多患者在术后就会感觉眼睛发生干涩等，在术后要定期使用人工泪液滴眼进行治疗，并且要定期复诊，有很多干眼症患者在3-6个月内症状会得到明显缓解。
2、眩光：特别是瞳孔比较大的患者，在夜间有可能会产生眩光，特别是观看灯泡时会感觉有一圈光晕，此时通过滴用滴眼剂，长时间适应后慢慢症状就会好转。
3、近视回退：特别是在术前近视度数没有稳定，术后患者长期近距离用眼，有可能会有近视回退。