当甲型肝炎抗体阴性时，通常可以排除感染甲型肝炎病毒，但是如果有典型的临床症状，如厌食、乏力、黄疸，此时如果粪便当中检测出HAV-RNA、甲型肝炎病毒颗粒或抗原时，也可以确诊是甲型肝炎病毒感染。
甲型肝炎抗体有两种，一种是IgG抗体，另一种是IgM抗体。如果IgM抗体阳性时，说明是近期感染的标志。如果HAV-IgM阳性时，可以确诊感染甲型肝炎病毒。抗-HAVIgG一般在急性期是阴性，在恢复期是阳性，抗体的低度如果较发病初期升高四倍以上时，也可以作为诊断甲型肝炎病毒感染的标志。