龟头疱疹通常考虑生殖器疱疹以及包皮龟头炎，生殖器疱疹是一种性传播的疾病，主要由于疱疹病毒感染所导致，而包皮龟头炎是包皮龟头的感染性疾病，通常可以由细菌、真菌、支原体、衣原体、滴虫等所导致。
对于疱疹病毒以及包皮龟头炎的鉴别，需要通过相应的实验室检查，如疱疹病毒的核酸检测等。对于治疗，如果是生殖器的疱疹，要给予抗病毒的治疗，避免性生活，而对于感染性疾病通常是给予抗感染的治疗。