月经持续不干净，先要判断是否由于卵巢囊肿所导致。如果月经周期时间＞15天，先需要前往医院行常规的检查，比如尿妊娠试验，排除是否有妊娠因素所导致。另外，行彩超检查判断子宫内膜的厚度，如果子宫内膜厚度比较厚，内膜回声不均匀，多数考虑子宫内膜剥脱不全所导致。此时可以给予药物的实验性治疗，比如黄体酮口服，在服用5-7天以后月经即可停止，停药撤退性出血。
如果在服用药物之间仍然出现月经不停，此时考虑合并病理性的改变，需要选择诊断性刮宫来判断子宫内膜是否有病变，根据内膜的病理结果进行合适治疗。
大部分卵巢囊肿对月经的影响比较小，因为卵巢囊肿多数为生理性囊肿或者滤泡囊肿，不是功能性囊肿，对月经影响比较小。所以对于月经长期干净，先需要根据病因进行相应的判断和治疗。