牙周炎晚期主要需尽早、尽快治疗牙周炎，这是因为牙周炎本身是慢性进行性破坏性疾病，即使该疾病本身有间歇期、进展期，但最后结果是如果不治疗，牙周炎可继续进展，牙齿继续松动，甚至自行脱落。所以在牙周炎发生的各个时期，都需要进行积极牙周病系统治疗。
牙周病系统治疗，包括自身口腔卫生措施维护，也就是首先要学会正确的自我刷牙方法，同时可以辅助使用牙线、间隙刷、冲牙器，一定要认真刷牙。认真刷牙程度，在牙周炎治疗效果维护中起到非常重要作用。另外，牙周炎系统治疗还包括洁牙、刮治，甚至牙周手术。对于不能保留的牙周病、松动牙齿，及时进行拔除，拔除以后及时进行牙齿修复、调和，甚至对于拥挤不齐牙周病患牙，也可以进行正畸矫正排齐牙齿。此外，需要戒烟，因为吸烟对牙周炎有不利影响，还需控制体重、控制糖尿病。