系统性红斑狼疮的治疗目前以激素类的药物以及免疫抑制剂治疗为主，激素类的药物大剂量使用后可能有诱发糖尿病的风险，还可能会引起消化性的溃疡。除此之外，长期使用有诱发骨质疏松以及股骨头坏死的风险，激素类的药物还能引起脂肪的重新分布，例如出现满月脸、水牛背的情况，免疫抑制剂也会出现很多不良反应，例如可能会导致肝功能或肾功能的异常，还可能引起白细胞下降、食欲下降、乏力、头晕、腹泻、恶心、呕吐等症状，也有的患者会出现皮疹和焦虑症状，长期使用免疫抑制剂可能会降低身体的免疫力，容易引起感染性的疾病，例如出现呼吸道感染、病毒性疱疹等。并不能因为用药会出现副作用，就拒绝用药治疗，因为药物可能会引起不良反应大部分都有应对的预防措施，如果不经过正规的治疗程疾病可能会进一步进展，引起内脏的不可逆的受损，严重时可能会危及生命，应当在医生的指导下规范的进行治疗。