目前临床上对于阴茎癌的诊断需要根据病史、临床表现、实验室辅助检查以及病理组织学检查结果等方面来决定，对于阴茎部的浸润性的溃疡性病变或无痛性的赘生性乳头状病灶，并且患者还出现了腹股沟淋巴结的肿大。
既往又有包皮过长，就建议患者做超声波检查，必要时还需要做磁共振检查。此外还需要对病灶进行细胞学或组织学检查以明确病理性质，同时还需要做盆腔CT、腹部CT和胸部CT检查，以明确病变侵犯、转移的情况。
对于有疼痛的还需要做全身骨扫描检查以明确或排除骨转移的情况。