做胃镜是发现和确诊贲门癌的最直接手段，在胃镜下，可以看到贲门部位的形态和结构，有没有肿物、溃疡。
并可以直接观察肿物、溃疡的外形特征，溃疡的边缘是否光滑、底部是否凹凸不平、是否有污秽的苔覆盖在表面、溃疡的底部是否有出血等情况，最重要的是可以在胃镜下取组织，送病理检查来确诊、排除贲门癌。
需要注意的是有一部分的贲门癌患者，癌肿主要位于胃壁内，所以在普通的胃镜下并没有见到明显的癌肿、癌性溃疡，则需要通过超声胃镜才能够发现胃壁内的肿瘤，并在超声胃镜下取组织，做病理检查来确诊贲门癌。