按照规定的免疫程序进行乙型肝炎疫苗接种，有96%的人可以产生乙型肝炎表面抗体，另外有4%的人会出现免疫失败，未产生乙型肝炎表面抗体。未产生抗体的原因比较多，主要有以下几种：
1、抗原量不够：因为抗体是由于抗原刺激才能产生抗体，由于个体差异，有的人可能需要更多的抗原刺激才能产生抗体。所以，可能存在剂量不足的问题。乙型肝炎疫苗就是抗原制成，以往是血源性的乙型肝炎疫苗，是从乙型肝炎病人血液中提纯的乙型肝炎表面抗原制成。目前乙型肝炎疫苗是基因工程疫苗，是采用基因工程技术提纯的乙型肝炎表面抗原，如果是因此没有产生抗体，可以加大剂量注射。
2、不能够产生抗体：有种情况可能是因为机体的免疫力差，或者是服用了一些免疫抑制的药物，使机体的免疫功能不能产生足够的抗体来抵抗，还有天生没有乙型肝炎病毒的受体，免疫系统不能对乙型肝炎病毒做到应对的反应，就不会产生抗体。
3、疫苗有问题：可能是疫苗在储存、运输和使用过程中，温度过低、过高使疫苗冻结或凝结，导致乙肝疫苗的效价降低。