溃疡性结肠炎是一种慢性结肠炎，是自身免疫紊乱性疾病，病因尚未完全明确，目前认为是由于多因素相互作用导致，主要包括环境因素、遗传因素、肠道微生态和免疫等因素，其中肠道免疫系统失调而导致炎症过程，在溃疡性结肠炎的发病中起着重要的作用，基本病因包括：
第一、免疫因素，是指由于各种因素导致炎症因子分泌过多，肠道黏膜持续处于炎症状态，肠黏膜屏障功能损伤，这个过程在溃结的发病中起了重要作用；
第二、遗传因素；
第三、肠道微生态，溃结的发病与患者肠道内菌群的种类、数目紊乱以及功能异常有关。
溃疡性结肠炎的发病因素尚未明确，是多因素相互作用所导致。