结缔组织病种类繁多，不同的疾病其症状特点、病情轻重、预后都不尽相同，预期寿命差距很大，可能会导致死亡，也可能并不会影响寿命。
结缔组织病的病程长，病情比较复杂，亦多合并多系统、多脏器损伤。不同的结缔组织病，其受累的脏器的严重程度不同，如系统性红斑狼疮，可以造成机体重要脏器的不可逆损伤，病情比较重，具有一定的致死性。干燥综合征虽然可以侵及人体多个系统，但是多数患者症状比较轻，病情进展比较慢，预后比较好，部分患者甚至终身不知道自己患有什么病。
不论所患有何种的结缔组织病，目前随着医疗水平的进步，以及新药的研发，通过系统、规范化的治疗，多数结缔组织病患者的病情可以长期稳定。