大部分肺脓肿的患者是可以临床治愈，其治愈率达到90%-95%左右，其病死率也是很低。肺脓肿的预后通常情况下，与肺脓肿有并发症、患者的基础状态，以及感染的致病原等多因素有关。当肺脓肿患者出现脓腔破裂形成脓胸时，以及因胸廓塌陷、胸膜的纤维化等，导致患者出现呼吸衰竭时，此时患者的预后不良，有一定的死亡率。另外，对于因癌症继发支气管阻塞形成的肺脓肿，以及免疫抑制状态下的肺脓肿患者，其病死率也较高，可以达到60%-70%左右。对于严重的混合感染，其病死率也较高，可以达到20%左右。故对于上述特殊情况的肺脓肿患者，要早期针对性的予以抗感染治疗，以及支持对症处理，以降低其病死率。