来氟米特是一个免疫抑制的药物，所以副作用可能是跟这个药物的作用相关。首先比较常见的不良反应，包括对血液系统的影响，比较常见的是白细胞减少。有的患者使用之后，会出现轻度的过敏反应。在代谢和营养方面，可能会导致肌酸激酶的升高，偶尔也会见到电解质的异常。
神经系统的不良反应，比较常见的表现是精神感觉错乱、头痛、头晕以及外周神经病变。在心血管系统，可以表现为血压的轻度升高。对于胃肠道系统，比较常见的不良反应包括结肠炎，还有腹泻、恶心、呕吐以及口腔黏膜疾病等等。对于肝胆疾病，可能会导致肝酶的轻度升高。皮肤的不良反应包括有脱发、湿疹、皮疹、瘙痒和皮肤干燥，还可能会导致腱鞘炎的发生。所以这个药物不良反应比较多，也需要重点观测一下。