脚灰指甲目前常用的是规范的口服抗真菌药治疗，脚灰指甲也称为甲癣或甲真菌病，是指真菌感染甲板或甲下引起的疾病，真菌学检查阳性。患者应该首先到医院，进行皮肤科脚趾甲的真菌学检查，明确是甲真菌病。甲真菌病由于甲板角化，药物不易透入，一直是治疗的难点。近年来，由于唑类药物、丙烯胺类药物的问世，甲真菌病的治疗有了很大的进展。
甲真菌病的治疗可以口服、外用药物，或手术拔甲，目前常用的是口服药物和外用药物。脚趾甲的生长速度较慢，完全替换一个新的趾甲大约要300天，所以治疗甲真菌病必须要有耐心。口服药物，如口服特比萘芬片、伊曲康唑、氟康唑等，可治愈80%以上的甲真菌病。在治疗过程当中，应定期监测药物的不良反应。外用疗法根据药剂不同，主要采取局部涂药和封包削治等方法。局部可以30%的冰醋酸外涂，或10%的冰醋酸泡病甲，涂药前若先将病甲削薄，疗效更佳，也可以外用特比萘芬、阿莫罗芬搽剂、环吡酮胺、环吡酮胺甲涂剂等抗真菌的外用药局部涂抹。