想要防止尖锐湿疣复发，首先是每次治疗的时候可先做醋酸白试验，发现肉眼不可见的亚临床感染，并将其清除。其次就是要严格遵照医嘱，定期复诊。如果治疗间隔时间过长，残余的HPV病毒就可以再次复制增多，这样就容易导致复发频率增加。
再次可以考虑采取新的方法，比如艾拉光动力治疗，就可以有效清除局部潜在的HPV感染灶，起到减少复发的作用。另外，从整体上讲可以吃或者是注射提高机体免疫力和抗病毒能力的药物，比如肌肉注射干扰素，口服胸腺肽、转移因子等等。另外，还要保证良好的生活作息，避免过于劳累，以及酗酒等，这些都有利于尖锐湿疣的痊愈。