非典是以对症治疗为主，例如发热的患者可以使用美林或扑热息痛退热治疗。如果患者出现了液体量的不足，要进行积极的补液，但患者出现心功能不全时，需要进行强心、利尿、扩血管治疗。
如果患者出现了呼吸衰竭，需要使用无创呼吸机，甚至有创呼吸治疗。当患者合并的细菌感染时，需要使用抗生素进行治疗，例如头孢哌酮、莫西沙星、红霉素等。
同时完善痰培养的检查，可根据药敏结果试验更换抗生素。如果患者有痰咳不出，可使用祛痰药物，例如氨溴索、溴己新等。