对于多囊卵巢综合征的患者，治疗上首先需要进行调节生活方式，对于肥胖型多囊卵巢综合征的患者，应该通过控制饮食和增加运动来降低体重并且缩小腰围，而且可以增加胰岛素的敏感性，降低胰岛素和睾酮，从而有可能会恢复排卵以及生育功能。
药物治疗的方法需要进行调节月经周期，比较常用的是口服避孕药，尤其是雌孕激素的联合周期疗法，同时也可以用一些孕激素进行后半周期疗法，可以调节月经，并且对于子宫内膜能够起到一定的保护作用。如果出现了一些雄激素水平过高的现象，则需要进行一些降雄激素水平的药物治疗，比如应用一些地塞米松等，或者是应用一些环丙孕酮、螺内酯等这样的一些方法来进行。
除此之外，还需要进行胰岛素的检查，来除外是否有胰岛素抵抗，对于肥胖或者是有胰岛素抵抗的患者，常常需要用二甲双胍来进行胰岛素的增敏。如果对于有性生活而且还有一些生育要求的患者，可以进行一些诱发排卵的治疗。
如果上述治疗完全没有效果，必要的时候也是可以选择手术治疗的，比如说腹腔镜下的卵巢打孔甚至是楔形切除，但是目前应用手术来进行治疗多囊卵巢综合征的临床手段已经很少应用了。