新生儿肺部感染需要积极的住院进行治疗，应及时查明病原体，给予抗感染治疗，抗感染的药物有青霉素类、头孢菌素类和大环内酯类抗生素。新生儿肺炎可以是吸入性的，比如羊水吸入或者有胎粪吸入；也可能是感染性的，比如宫内或者宫外感染性肺炎。
酌情给予氧气吸入、纠正水电解质及酸碱紊乱、营养支持。住院病人给予心电和指脉氧监护，随时观察病情变化，咳嗽、咳痰严重时还需要给予雾化吸入、拍背吸痰。反复高烧或者持续高烧的新生儿，需要物理降温，新生儿肺部感染经过及时的规范治疗是可以治愈的，一般预后良好，有少部分新生儿病情加重危及生命，可能需要气管插管机械通气治疗。