如果确定是细菌感染导致的反复高烧，首先应该采取抗菌药物治疗，抗菌药物的选择一般会结合感染的部位，常见情况如下：
1、呼吸道感染：通常是革兰氏阳性球菌感染的几率比较高，可以选择青霉素类、头孢类以及喹诺酮类的药物，来进行抗感染治疗。
2、胃肠道感染：通常是革兰氏阴性杆菌感染的几率比较高，一般会选择氟喹诺酮类药物以及二代或者三代的头孢来治疗。
3、泌尿系统感染：通常见于革兰氏阴性杆菌引起的感染，最多见的是大肠杆菌，首选的药物是氟喹诺酮类药物，或者三代头孢。
4、急性胆囊炎：通常是见于革兰氏阴性杆菌感染，同时还会合并有厌氧菌感染，一般需要采用三代头孢、氟喹诺酮类药物，同时联合抗厌氧菌的药物治疗，比如甲硝唑。
5、中枢神经系统感染：一般会选择三代头孢进行抗感染治疗，比如头孢曲松，该药易透过血-脑屏障，所以中枢神经系统的细菌感染，一般会选择头孢曲松来进行抗感染治疗。
如果上述这些感染，经过抗感染治疗后效果不好，要及时更换抗菌药物。