儿童出现扁桃体结石，可能会造成患儿出现咽喉部堵塞感、异物感等不适感受，患儿可能会出现反复咳嗽、清嗓子等动作行为，甚至逐步形成此种习惯，对正常生活或者学习造成一定程度影响。
此外，结石状分泌物还会对扁桃体局部形成持续慢性刺激，有可能造成扁桃体逐步增生、肿大，进一步影响患儿呼吸通气，甚至造成扁桃体过度肿大，引起睡觉时有明显打呼噜，以及持续张口呼吸等表现，对睡眠质量产生明显不良影响。因此，患儿出现明显扁桃体结石状况时，可以进行定期清理，平常也需要注意保持口腔咽喉部清洁状态。