甲硝唑栓主要用于治疗滴虫性阴道炎和细菌性阴道病，并不会加重霉菌感染。霉菌感染主要是由于假丝酵母菌在体内的繁殖，其病因是和阴道的局部抵抗力下降有关，多见于糖尿病患者的血糖控制不理想、妊娠，或者患者使用广谱抗生素、免疫抑制剂等，导致阴道内的局部微环境免疫功能下降，引起假丝酵母菌的大量繁殖，并且由孢子相转化为菌丝相，从而引起阴道炎症。
甲硝唑栓属于硝基咪唑类的阴道栓剂，主要应用于厌氧菌感染所导致的细菌性阴道病以及滴虫性阴道炎，阴道局部用药可以有效的改善阴道炎症。而对于霉菌，治疗方法是以抗真菌药物为主，一般多选择硝酸咪康唑栓、克霉唑栓以及制霉菌素阴道栓，全身用药包括氟康唑和伊曲康唑，根据患者的症状以及患者是否有反复发作等因素来选择具体的用药疗程，同时性伴侣要进行治疗。