肝病需要抗病毒药物治疗的主要就是乙型肝炎和丙型肝炎，乙型肝炎的抗病毒药物主要是干扰素及核苷类抗病毒药物。核苷类抗病毒药物最早应用的是拉米夫定，之后又有阿德福韦、替比夫定、恩替卡韦、替诺福韦、丙酚替诺福韦等。目前临床上主要应用的是干扰素、恩替卡韦、替诺福韦和丙酚替诺福韦，因为拉米夫定、阿德福韦等药物耐药率都很高，丙酚替诺福韦、替诺福韦具有高效低耐药的优势。
丙型肝炎抗病毒治疗以往都是应用干扰素和利巴韦林进行抗病毒治疗。目前因为小分子药物的问世，已经替代了干扰素和利巴韦林的治疗，因为小分子药物疗效更好，疗程更短，目前常用的小分子药物，如索磷布韦、维帕他韦。